ในปี ค.ศ. 1976 ชายหนุ่มอาชีพคนขับรถบรรทุกนามว่า ทราวิส เกรดี้ ได้ตัดสินใจเดินทางตัดผ่านเมืองไซเลนท์ฮิลล์ เพื่อใช้เป็นทางลัดในการไปยังเมืองบราห์มส์ที่อยู่ปลายทาง แต่ยังไม่ทันจะถึงที่หมายเขาก็พลันเห็นคนสวมชุดคลุมวิ่งตัดหน้ารถ จึงรีบเบรคกะทันหัน พอลงมาดูก็พบกับเด็กผู้หญิงคนหนึ่งจากเงาสะท้อนบนกระจกด้านข้างเลยวิ่งตามไป จนได้ไปเจอกับบ้านหลังหนึ่งที่กำลังเกิดเพลิงไหม้พร้อมกับได้ยินเสียงกรีดร้องของเด็กผู้หญิงจากข้างในบ้านหลังดังกล่าว ทราวิสเลยฝ่ากองเพลิงเข้าไปช่วย ปรากฏว่าเด็กคนนั้นได้ถูกไฟคลอกไปแล้วทั้งตัวกลางวงพิธีบูชายัญ แม้ทราวิสจะเสี่ยงตายอุ้มเธอออกมาได้สำเร็จ แต่สุดท้ายเขาก็หมดสติล้มลงตรงหน้าบ้านในที่สุด
ทราวิสฟื้นขึ้นมาวันรุ่งขึ้นภายในเมืองไซเลนท์ฮิลล์ พร้อมกับเป็นห่วงอาการของเด็กคนที่เขาช่วยเหลือไว้ เลยหาทางไปยังโรงพยาบาลอัลเคมิลล่าที่ตั้งอยู่ในเมือง ที่นั่นเขาได้พบกับหมอ ไมเคิล คัฟแมนน์ ที่ยืนยันว่าไม่มีเด็กโดนไฟคลอกมาเข้ารับการรักษาเมื่อช่วงเร็ว ๆ นี้ ทราวิสเลยสำรวจที่โรงพยาบาลต่อ และพบกับเด็กผู้หญิงคนนั้นอยู่ในเงากระจกบานใหญ่ ทว่าตัวเธอในเงากระจกกลับดูแล้วปกติดี ไม่มีร่องรอยของแผลไฟไหม้เลย พอทราวิสได้สัมผัสกับกระจก เขาก็หลุดเข้ามายังอีกโลกหนึ่ง (ตรงนี้ขอเรียกแบ่งเป็น โลกปกติ กับ โลกสนิม ละกันนะครับ) พร้อมกับได้รับเครื่องรางชื่อ ฟลอวรอส (อ่านว่า ฟลอว-รอส) ที่มีรูปทรงคล้ายพีระมิดมาด้วย เมื่อกลับมายังโลกปกติได้อีกครั้ง ทราวิสก็พบกับ ลิซ่า การ์แลนด์ พยาบาลสาวที่แจ้งกับตนว่าเด็กผู้หญิงคนที่ถูกไฟคลอกมีชื่อว่า อเลสซ่า กิลเลสพี แต่เธอนั้นเสียชีวิตไปแล้ว
(ล่าง / จากซ้ายไปขวา) ทราวิส เกรดี้ / อเลสซ่า กิลเลสพี
ต่อมาทราวิสก็ได้เจอหญิงคนหนึ่งที่ชื่อ ดาห์เลีย โดยเธอเป็นแม่แท้ ๆ ของอเลสซ่า ซึ่งดาห์เลียเป็นคนจากลัทธิที่เรียกตนเองว่า "ภาคี" และมีแผนที่จะใช้อเลสซ่าเป็นเครื่องสังเวยในการให้กำเนิดพระเจ้า เนื่องจากอเลสซ่าเป็นเด็กที่มีพลังจิตสูงมาตั้งแต่เกิด ทว่าการมีพลังเหนือธรรมชาติของอเลสซ่ากลับกลายเป็นดาบสองคม เพราะเธอต้องโดนแม่ทารุณกรรมอย่างหนักเพื่อบังคับให้เข้าร่วมพิธีกรรมตามความเชื่อของลัทธิ อีกทั้งยังโดนเพื่อนในโรงเรียนรุมบุลลี่และกล่าวหาว่าเธอเป็นแม่มดด้วย
ทราวิสพบว่าอเลสซ่าต้องการจะให้เขารวบรวมชิ้นส่วนของฟลอวรอสให้ครบเพื่อประกอบมันให้เป็นเครื่องรางที่สมบูรณ์ ซึ่งหากทำสำเร็จ อเลสซ่าจะได้พลังกลับคืนมาและปลดปล่อยตัวเองให้หลุดพ้นจากดาห์เลีย พิธีสังเวยเพื่อให้กำเนิดพระเจ้าจะได้ล่ม ขณะที่ทราวิสตามสืบเรื่องของอเลสซ่า เขาก็ค่อย ๆ ปะติดปะต่อเรื่องราวของตัวเองในอดีตที่เกี่ยวกับเมืองไซเลนท์ฮิลล์ได้เช่นกัน โดยสมัยที่ทราวิสยังเป็นเด็ก เฮเลน (แม่ของทราวิส) เกิดล้มป่วยและมีอาการทางจิตขั้นรุนแรง เธอเห็นภาพหลอนและคิดว่าลูกชายของตัวเองเป็นเด็กปีศาจ จึงพยายามหาทางรมแก๊สตัวเองให้ตายไปพร้อมกับทราวิส เคราะห์ดีที่เจ้าหน้าที่ตำรวจบุกเข้ามาช่วยไว้ได้ทัน ริชาร์ด (พ่อของทราวิส) เลยส่งตัวเฮเลนไปเข้ารับการรักษาที่โรงพยาบาลประสาท หลังจากนั้นสองพ่อลูกก็แวะเวียนไปเยี่ยมเฮเลนเป็นระยะ ซึ่งทั้งคู่เข้าพักที่ห้องหมายเลข 500 ของโรงแรมริเวอร์ไซด์ในช่วงระหว่างที่ไปเยี่ยมเธอ
(ล่าง / จากซ้ายไปขวา) ดาห์เลีย กิลเลสพี / ไมเคิล คัฟแมนน์ / ลิซ่า การ์แลนด์
อย่างไรก็ตาม อาการของเฮเลนไม่มีทีท่าว่าจะดีขึ้นเลย นางมักมีพฤติกรรมเกรี้ยวกราดและร้องหาลูกชายอยู่ตลอดเวลา เวลาผ่านไปนานวันเข้า ริชาร์ดก็ตกอยู่ในภาวะซึมเศร้า แม้ว่าจะตนเองจะโกหกกับทราวิสว่าเฮเลนตายไปแล้ว แต่ด้วยความไร้เดียงสา ทราวิสก็ยังเอาแต่เขียนจดหมายหาแม่อยู่เรื่อย ๆ กระทั่งวันหนึ่ง ริชาร์ดที่ไปต่อไม่ไหวกับสภาพจิตใจของตัวเองหลังต้องรับรู้ว่าเฮเลนไม่มีทางกลับมาเป็นเหมือนเดิมแล้ว เลยตัดสินใจผูกคอตายภายในห้องพัก ทราวิสที่ออกไปเล่นข้างนอก พอกลับมาที่ห้องและเห็นศพพ่อก็พาลเข้าใจและหลอกตัวเองว่าพ่อแค่หลับไป กระทั่งพนักงานทำความสะอาดของโรงแรมเข้ามาพบสองพ่อลูกในเช้าวันถัดมา
เมื่อทราบเรื่องราวทั้งหมดและทำใจยอมรับสิ่งที่เกิดขึ้นกับตัวเองได้แล้ว ทราวิสจึงบุกไปขัดขวางพิธีกรรมที่คนในลัทธิ (รวมถึงหมอคัฟแมนน์) กำลังรายล้อมร่างอันไหม้เกรียมของอเลสซ่าเพื่อรอการบูชายัญได้สำเร็จ ทางด้านอเลสซ่าก็ได้ใช้พลังจากฟลอวรอสสร้างเด็กทารกขึ้นมาโดยมีวิญญาณของตัวเองอยู่ในร่างเด็กครึ่งนึง แล้วนำไปทิ้งไว้ ก่อนที่ แฮร์รี่ เมสัน (พระเอกของเกม Silent Hill ภาคแรก) กับภรรยาจะมาพบและรับไปอุปการะ ซึ่งแฮร์รี่ได้ตั้งชื่อเด็กทารกคนนั้นว่า เชอริล
วิธีปลดล็อคฉากจบอื่นในเกม
ฉากจบ Bad Ending - ต้องจบเกมอย่างน้อย 1 รอบก่อน จากนั้นพอดูเครดิตจนจบ เกมจะให้เราสร้างเซฟสำหรับเล่นรอบใหม่ แล้วให้เล่นรอบ 2 ด้วยเซฟดังกล่าวและจบเกมอีกครั้งโดยระหว่างนั้นให้สังหารศัตรูให้ได้มากกว่า 200 ตัวขึ้นไป พอเคลียร์เกมได้ก็จะเจอฉากจบนี้
ฉากจบ UFO Ending - ต้องจบเกมอย่างน้อย 1 รอบก่อน จากนั้นพอดูเครดิตจนจบ เกมจะให้เราสร้างเซฟสำหรับเล่นรอบใหม่ แล้วให้เล่นรอบ 2 ด้วยเซฟดังกล่าว พอเล่นไปถึงช่วงต้นเกมที่ทราวิสฟื้นขึ้นมาหน้าโรงพยาบาล Alchemilla เมื่อบังคับตัวทราวิสได้อีกครั้ง ให้ไปยังที่ทำการไปรษณีย์ (Post Office) ที่อยู่ใกล้กับโรงพยาบาล ตรงชั้นบนสุดของบันไดหนีไฟจะมีกุญแจ Room 502 Key อยู่ ให้เก็บมา กระทั่งถึงช่วงท้ายเกมที่เรามาถึง Riverside Motel ให้นำกุญแจที่ได้มาไปไขประตูก็จะเจอฉากจบนี้
วิธีปลดล็อคเสื้อผ้าชุดพิเศษของทราวิส
Ambassador - จบเกมแบบ UFO Ending
Brawler - จบเกมโดยสังหารศัตรูด้วยหมัดไม่ต่ำกว่า 50% ของจำนวนศัตรูที่จัดการไป
Butcher - จบเกมแบบ Bad Ending
Cartographer - จบเกมโดยกดดูแผนที่น้อยกว่า 25 ครั้ง
Codebreaker - ระหว่างที่เล่นเกมรอบที่สอง ให้กดปุ่ม บน บน ล่าง ล่าง ซ้าย ขวา ซ้าย ขวา กากบาท วงกลม (Konami Code)
Collector - จบเกมโดยเก็บไอเทมมามากกว่า 300 ชิ้น
Daredevil - จบเกมโดยไม่เซฟเกมเลยแม้แต่ครั้งเดียว
Explorer - จบเกมโดยเดินหรือวิ่งรวมกันเป็นระยะทางกว่า 22.5 กิโลเมตร
Fireman - ช่วงเริ่มเกมที่เราต้องเข้าไปช่วยอเลสซ่าออกมาจากบ้านที่เพลิงไหม้ ให้เราช่วยเธอออกมาให้ได้ภายในเวลา 80 วินาที
Savior - จบเกมรอบแรกก็จะได้มาเลย
Sharpshooter - จบเกมโดยสังหารศัตรูด้วยอาวุธปืนกว่า 75% ของจำนวนศัตรูที่จัดการไป
Splinter - จบเกมโดยใช้เวลาไม่เกิน 2 ชั่วโมง
Stalker - จบเกมโดยใช้ไฟฉายเป็นเวลาน้อยกว่า 3 ชั่วโมง
Weaponsmith - จบเกมโดยสังหารศัตรูด้วยอาวุธระยะประชิดกว่า 75% ของจำนวนศัตรูที่จัดการไป
วิธีปลดล็อคไอเทมพิเศษ
Moon Gauntlet - จบเกมรอบแรกก็จะได้มาเลย
คุณสมบัติ - เป็นสนับมือพลังโจมตีสูงที่ใช้ต่อยศัตรูทั่วไปให้ตายได้ภายใน 1-2 หมัด (ยกเว้นบอส) และไม่มีวันพังเสียหาย
Great Cleaver - จบเกมแบบ Bad Ending
คุณสมบัติ - เป็นมีดพลังโจมตีสูงที่ใช้ฟันศัตรูทั่วไปให้ตายได้ภายใน 1-2 ที (ยกเว้นบอส) และไม่มีวันพังเสียหาย
Tesla Rifle - จบเกมแบบ UFO Ending
คุณสมบัติ - เป็นปืนไรเฟิลที่ยิงศัตรูทั่วไปให้ตายได้ภายในไม่กี่นัด (ยกเว้นบอส) และมีกระสุนให้ใช้ไม่จำกัดจำนวน
Fire Axe - ช่วงเริ่มเกมที่เราต้องเข้าไปช่วยอเลสซ่าออกมาจากบ้านที่เพลิงไหม้ ให้เราช่วยเธอออกมาให้ได้ภายในเวลา 80 วินาที
คุณสมบัติ - เป็นขวานพลังโจมตีสูง (แต่ไม่เท่า Great Cleaver) ที่ปลดล็อคได้ตั้งแต่การเล่นรอบแรก และไม่มีวันพังเสียหาย อีกทั้งใช้พังประตูบางบาน หรือทำลายแม่กุญแจที่ล็อคบางประตูได้ด้วย
Night Vision Goggles - จบเกมโดยใช้ไฟฉายเป็นเวลาน้อยกว่า 3 ชั่วโมง
คุณสมบัติ - เมื่อสวมแล้วจะสามารถมองเห็นและเก็บไอเทมต่าง ๆ ในพื้นที่ที่มืดสนิทได้โดยไม่ต้องใช้ไฟฉาย
ติดตามข่าวเกมพีซี/คอนโซลอื่นๆ ได้ที่ Online Station